いつものように鼻歌を歌いながら家に着いて、 モンちゃんを膝に乗せて、今日の大変さについての報告（世間で言うところの愚痴という奴） を呑気に聞いていたら（つまり、馬の耳になんとやら、という奴ですな）、 何かがカチンと来たみたいで、ふと見ると、 …

昨日の獲物を印刷しておく。 Sekimoto (2007) PRE を発見。 そうか、もうあれから 10 年経ってるのか、と愕然とする。 （というのは Sekimoto 1997 のこと。） 6/18/2004: 「ゆらぎのエネルギー論」

Brownian dynamics 検証 run - 粒子編。 週末の結果をひとまとめ。やはり、どうしても途中で停止する。 overlap の処理の検討： 今までは、 overlap をチェックし、してたら dt を縮め、それが下限を切ったら random vector を作り直し、としている。 これを…

一夜明けて、 いつもの（ちょっと困った）ハイパー・モンちゃんが戻ってきた。 付き添った人曰く、小屋から出るときも入るときも、嬉しそうにジャンプしているのだそうだ。 やれやれ。

予定通り、 今日のモントンは、はじめてお医者に連れていかれた。 それでいきなり２本もブスッと刺された（後ろ足に）。 一本目は少し声を出したけど、辛抱強かった。 その興奮も冷めない直ぐ後に、反対の足に２本目がブスっと。 刺された時はまだ辛抱できた…

ports, freshports 11/4/2007: 0.9 Released. 6/15/2008: kurt rosenwinkel's solo.

普段はヘトヘトな（自称）おねえちゃん（しつこい？）に代わって、 今日もおにいちゃんが全権を預かる。（但し、今日はおねえちゃんは、 おにいちゃんの行動を逐一観察、まぁ授業参観みたいなもんだな。） エキサイトしてくると、結構やんちゃになってきて、…

今日は（自称）おねえちゃんがお出掛けなので、おにいちゃんが全権を預かる。 結構、お互いにハッピーで、穏やかに過ごしたような気がする。 モンは、ちょっと注意力散漫かな？好奇心が旺盛なのと、怒られたら現実逃避しがちなのが 混ざってる感じ。知能は格…

Brownian dynamics semi-implicit predictor-corrector スキームの実装、続き。 libstokes/test にチェックを追加。 細かい修正の後、全てパス。 non-Brownian ３体落下で、同じようにテストする。 期待通り２次スキーム並であることが確認出来た。 4/15/200…

今日で満８週間になった （と言うことは、２００７年１０月１９日生まれと言うことだ）。 ご要望にお答えして、ちょっと photo gallary: 何だか MORI LOG ACADEMY か、最近のスタパブログかって感じだな。 最近、一人で雪道を細心の注意を払って家に向かう車…

時々ドキッとすることがある。 今回はまつもとさんの日記。何で森博嗣がネタになるんだろう、と。 数少ない回覧ブログの間に ふっと相関関係が現れると、世界は狭いなぁと思う。 引用： 小説家とプログラマは、元手がほとんど要らない点や、 ひとつの世界を…

In a few days, I was stuck in some problem on ARPACK. Some check in libstokes using ARPACK failed on openSUSE (although the same code is just fine on FreeBSD and SUSE-Linux). By comparing the behaviors between openSUSE and FreeBSD step-by-…

昨日の収穫物をまとめておく（だけ、まとめておく）。 一本 slip の実験の論文に目を通す。 alex が興味を持ちそうなのでメールしておく。 その後 alex が来て、ついでに質問を聞くが、 その場ではよく分からなかった（shear viscosity と bulk viscosity の…

Brownian dynamics 検証 run - 粒子編。 昨日の結果を眺める。 rej 版でも見てみる。やはり dt をかなり小さくしないとダメだな。 JGdP の場合も、dt が大きいとFBの計算でこける。 semi-implicit predictor-corrector スキームを自分なりに実装。 Jendrejac…

おもしろい。こういう柔軟さは、さすがだな。 （Knuth の本の索引を思い出す。） 日本国内のジャーナルが、 local language という文脈ではなく、 こういう路線を率先して進めるということがあったら、おもしろかったのにな。 （APS のこの試験的な動きが確…

DIP: 時間発展チェック終了に伴い、復帰。 12/3/2007に戻ってきた、ということ。 基本的に全部やり直し。 1/16/2008: debug 中だが demo として再開。

Brownian dynamics 時間発展スキームのチェック implicit のチェック、続き（２）： quaternion の処理の確認。 quaternion が nan になっている。 追っていくと、 check code の初期化がまずかった （全部０にしていた）。最後の要素だけ１にする。 これで1…

３ヵ月に１度の儀式だな。 今回は \$9 程度余った（ということは \$15 使った、ということか）。 9/15/2007: 前回の top up. 3/11/2008: 残高は keep される？

最高気温がプラス１度で、道路の雪も路面からはほとんど消えた。 空は曇りで、風が強い。

Brownian dynamics 時間発展スキームのチェック implicit のチェック、続き： libstokes/test に check-bd-imp.c を書く。 まず evolver のチェック。 この際、汚い処方を改めて、綺麗に書く（データ構造とメモリ管理の話）。 explicit の evolver と比較を…

セミナー "Functional nanomaterials: from material design to diagnostic applications" (Teodor Veres, NRC-IMI) NRC の別の研究所の、ナノ関係のグループ・リーダーなのかな。 一通り、 big picture を話した、という感じ。 出自は磁気系で、 micro-, na…

最近の文献から、また幾つか印刷はしておく（こういうのは、一期一会だから）。 セミナー "Imaging using photonic bandgaps, a novel endoscope, and terracing/fingering phenomena in nano and small scale droplets" (Richard Craster, Imperial College…

Brownian dynamics 時間発展スキームのチェック implicit のチェック： ノートにきちんと明らさまに書いておく。 一瞬、間違いを見つけたと思ったが、よく見ると実は正しかった。 その際の修正で core dump するようになって、そこからの復旧に一日潰す。

家にやって来てちょうど一週間になった （ってことは７週目ということだ）。 一番の懸念である「トイレ」のしつけは、なかなか思うようにはいかない （と言っても、失敗率は半分以下だけど）。 これは、半分は奴の知能レベルがもう少し上がるのを待つ必要が…

openSUSE 環境 (i1200) に RYUON を入れる。 blas, lapack は package を入れているみたいだが、 link でこけるので、 libblas.so と liblapack.so を ln -s しておく。 arpack は bue9(SUSE-Linux) 同様、自分で compile 。 etime_ がないと怒られたので、 …

I've just happened to know this big news. Actually some copies which I got 10 years ago (when I'm in Pasadena) are now in the storage at my parents house (in Japan) and I couldn't see them for a long time. So those PDF files are just great…

普通のシロクマになっちゃったな。まぁ当たり前か。 3/23/2007: [news] 育児放棄されたシロクマ赤ちゃん、初登場 独の動物園 4/7/2007: [news]シロクマ人気で動物園株が急騰 12/8/2007: [news] 1歳の誕生日にあいさつするクヌート君 1/18/2008: [news] 名前…

私も招待されていたらしいのだが、昨日のバタバタもあり、今日はパスさせてもらった。

RYUON のここ数ヶ月間の進捗状況をまとめておく。 Brownian dynamics 時間発展スキームのチェック explicit のチェック： 既存の schemes を Pe=∞ 対応にして、 non Brownian との比較を行う。 どれも期待通りの振る舞いをしていることを確認。 implicit に…

furnace 故障のため、修理に立ち会うため、（寒い）自宅に缶詰になる。 ちょうど良い機会なので、書斎に積んである論文の山を整理する。 一般的な興味の論文と、今集中しているネタに分けて、 今のネタを更に二つに分類した。 読みたいと思っていて、しかし…