ryuon

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  Brownian dynamics
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    検証 run - DNA 編。
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      rmin を simulator (stokes3-bd.c) に実装。 dna.scm が走るようになった。
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      結果を解析。 stncdump.py だけだと gnuplot script がひどいことになるので、 ana-chain.py を書く。
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    動く所まで来たので simulator を
    ryuon/stokes/src/stokes3.c に merge する。
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      一応、 non-Brownian で新旧 simulators が同じ結果を吐くことは確認。
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      帰宅後、 merge 完了。