市來健吾の日記

プログラマ、(元)物理屋(ナノテク、流体)

2007-09-01から1ヶ月間の記事一覧

BEM

gmsh geo file を解析。そいつを parse する code を書いてみる。 が、挫折(何か筋が悪い) gmsh で、たたき台の mesh をとりあえず作る。 さて、こいつを Elmer に import しようとしたが、出来ない…… Elmer しょうがないので、最初から Elmer で行ってみ…

BEM

gmsh の使い方を学ぶ。 何はなくとも mesh が必要だな、と思い。 一通り学んだ。 しかし、 GUI 嫌いという個人的な傾向もあってか、 データ構造を理解して自分でそのデータを作る script を書く方が正解な気がしてきた。 (MD の時の分子データをどう準備する…

ALF project

ARPACK の情報収集から、ある絵 (http://www.ericjhellergallery.com/index.pl?page=image;iid=8) に行き当たる。心に響いたので、activate しておく。 実は slip 版も出来たことだし、よい時機なのかもしれない。 見れば最後に触ったのは 1/25/2004。

ryuon

Brownian force の実装。 LAPACK でどこまで出来るのか? 調べたら、やっぱり昔 dgeev で遊んだことがあった。 (3/28/2005 辺り) ARPACKに戻る。 マニュアルを読む。実対称、実非対称、複素の3つのルーチンがあるだけ。 実際の運用は、そのルーチンを収束す…

長らく無かった我が家の録画環境、ふと思い立って HD recorder を買う。

誰かさんのお誕生日という口実で。 今更、特に凝ったことをしたい訳でもないので、ろくに調べもせず、 今手に入るもので安いものの中から選択。 結局 Philips の 160GB の モデルにする。税抜きで \$299 也。

ryuon

Brownian force の実装。 ARPACK を覗いてみる。 (elmer, calculix の関係で既に install されている模様)。

BEM

ports から gmsh のインストール、やっと終わる。 まだ遊んでない。

携帯電話にお金を追加しておいた。

3ヶ月前のお金が既に expire していたため。 今回も3ヶ月の下限の \$25 入れておく。 6/7/2007:前回の携帯のお金補充。 前にも書いたかもしれないが、この料金体系、いまいちよく分からない。 何で \$15, \$25, \$50, \$100 の expiry が それぞれ 45, 90, 1…

今日は比較的暖かい。

食料の買い物に行ってきた。

ryuon

Brownian force の実装。 更に文献を follow (2本)。ノート改訂。 帰宅後、テスト実装を開始。

BEM

ports から calculix, gmsh を入れてみる。 が、後者が opencascade って奴に依存していて、 こいつの build が終わらない…

X.org の upgrade でちとトラブった。

というのも、 db の登録部分で帰ってこなくて C-c してしまったせい (ちょっと短気だった…)。 こうなると db の整合性とか目茶苦茶になったようで、 よく分からないけど、面倒なので(こういう不精は良くないが) 必要部分を強制的に再 install して、とり…

グループ・セミナー、再開。

前回は7/17/2007。 何だが話者が全然プレゼン慣れしていないようだった。 7月にここであった workshop での一連のプレゼンを見てても感じたことだが、 理論家がプレゼン下手なのか?(そういう一般的な傾向でもあるのだろうか?) 個人的な興味は、プレゼン…

BEM

Elmer 遊び。一歩々々。

nanoプロジェクト

共同研究者の Alex が、 彼の集めた大量の PDF をメモリー・スティックに入れて、私にくれた。 これでは手も足も出ないので、一応、自分なりにリストにしてみた。 少し覗いてみたが、すぐに疲れた。 ここまでで気になった文献を印刷。

ryuon

Brownian force の実装。 これまで集めてた文献を一通り整理。うち3本に目を通す。 ここまでをノートにまとめておく。

twobody

数値的な lubrication の追い込み 昨日の結果の update. あと追加計算を投入。

Emacs 22.1

rectangle 関係の bindings が変わったかな? C-x r r で a と register a に copy して、 C-x g a で a を paste 出来てたと思ったが、 後者が C-x r g a になってる。 コマンドの名前なんか覚えてなかったが、 insert-register というらしい。 (C-x r r は…

寒い2。

初霜が降りたと、朝起きたら家の人が言っていた。

思い立って Emacs を 22.1 に version up

これまでは emcws で Canna を使ってたというかなり旧世代なもの。 一番の懸念は 22.1 に対応する emcws がないこと。 今時 Canna や Wnn でもないのは分かるけど、 何かこういう(いずれ廃れてしまうであろう、大事なんだけど本質的ではない) ものに対する…

BEM

Elmer で遊ぼうとする。 けれど、何がなにやらさっぱり分からない。 前に MD packages で遊んだときのことを思い出す。Tinker とか Gromacs とか。 底にたどり着くまでは、まぁ焦らず一歩々々進むしかない。 更にFEM関連の情報収集

twobody

数値的な lubrication の追い込み 既存の結果の update. 4時間半もかかった… ここのところ書き散らしてたノートの整理 (WORK/tex/note/20070607-slip) 未登録の文書を登録しておく。

寒い。

"Jazz Pioneer and 'Weather Report' Founder Joe Zawinul Dies" @voanews

8/18/1999: zawinul syndicate at catalina 1/4/2009: zawinul本、注文。 サマリ:訃報

お勉強

未整理文献の消化 主に DNA の分離の実験論文群から8本読んだ。疲れた……

BEM

更に巷に溢れている情報を収集。

BEM

ports から elmer を入れてみる。(まだ入れただけ。)

ryuon

短期的 TODO List をまとめる。

twobody

短期的 TODO List をまとめる。 8/18/2008: 論文、やっと完成しました。

nanoプロジェクト

最近、漁った論文を一通りまとめておく。