市來健吾の日記

プログラマ、(元)物理屋(ナノテク、流体)

2008-10-01から1ヶ月間の記事一覧

nanoプロジェクト

CF-cylinder @ westgrid jobの投入法も学んだので、 さっそく job を投入してみる。 どれくらいの速度で走っているのかな? 10/22/2008: N=400 終了。 10/23/2008: N=884 終了。 10/25/2008: job 終了。

ryuon

westgrid の環境整備。 libstokes/test の実施: ARPACK の second.f で gfortran が文句を言う。 web と lapack-3.1.1 を眺めると、 gfortran では internal etime を使うとよいらしいので、 しかるべく。 ってことで、テスト通過。 stokes のインストール…

ryuon

westgrid の環境整備。 libstokes の lub 関数用の厳密解計算ルーチンの compile が遅すぎるので、 手を入れる。 結局、 [XYZ]?.c と [XYZ]?-slip.c に手を入れる。 必要に応じて高次をコメントアウト。 これで4つの version すべてで、やっと compile が通…

「村上春樹に会いに行く」@aiaiときどきブログ

1/7/2009: 「内向き」で何か問題でも?@tatsuru.

7.1-BETA2 が出たみたい。

"FreeBSD 7.1-BETA2 Available"@freebsd-stable そうか、 RC じゃないのか……。 10/12/2008: 6.4-RC1 を install. 10/23/2008: 7.1-BETA2 を install.

モンちゃん、満一歳。

お誕生日プレゼントに、昨日買ってきたおもちゃをあげる。 やっぱり最近ちょっとマンネリだったみたいで、新しいおもちゃはすごくうれしいらしい。 よかった、よかった。

monk の season 7 を見始める。

TV

すると、何の前触れもなく、いきなり Dr Kroger が死んだことになってて、 何でだ?と思ってたら、最後に in loving memory of stankey kamel と出てきて、エーっと思って調べてみたら、役者さんが亡くなっていた。 "Stanley Kamel Dies At 65"@efluxmedia …

およばれ。

alex の家に。私ははじめて。 新築の、モダンな、彼好みなのかな、といった感じの、すてきな部屋であった。 「車で来るな」というお達しなので、家から歩いて行く。30分で着いた (モンちの散歩の片道程度の距離、ということだ)。 が、飲みすぎた(他のみ…

ryuon

westgrid の環境整備。 今更ながら、 website の文章に、 推奨されている compiler option を見つける。 うーむ、当たり前のことだったみたいだが、 64bit と 32bit は共存できなくて、 今まで必死に 32bit で compile したコードと システムに入ってる 64bi…

ryuon

westgrid の環境整備。 結局、全部自分で準備することにする。何が必要か、というと… 数学系: BLAS, LAPACK, ARPACK, NITSOL, GSL その他: guile, netcdf 何とか、一通りはできた(gcc version 3 系だけ)。 10/17/2008: 64bit 版で全部作り直し!

nanoプロジェクト

三者会談。 一昨日言っていたもの。 今後のことなど、いろいろと。 基本的に、規定路線で進めていきましょう、と (若干、スピード・アップが必要だけど……)。 12/22/2008: 2体厳密解の論文は、その後、音沙汰なし。

ryuon

westgrid の環境整備。 昨日の続き。 手元のコードは serial なので、まずは recommend されているサーバーでの 環境設定を目指す。 C コンパイラは xlc, gcc (version 3), gcc4 (version 4) がある。 まずはlibiter を持っていって compile. gcc, gcc4 とも…

portsを見ていたらvtk5何てのがあったので試してみた。

見てみたら version 5.0.3 という奴だった (ちなみに、これまでは 4.4.2)。 freshport の log によると tcl と python bindings は既に含まれているとのことだったので、 ものは試し、と早速入れてみた。 既存の script (stvis-vtk.py) は何の問題なく動い…

帰宅したら、前の家の大家から手紙が届いていた。

10日と言っていた security deposit が、休日を挟んで、届いた、ということ。 額面を見ると、200ドル引かれているだけで、ほっとする。 (もっとひどいことも起こり得ると心配していた。) その後、家で話し合いの結果、その200ドル (カーペットの…

ryuon

confinement の debug -- dumbbell: 50-50-10-10 の計算 on BUE9: siPC での計算。めちゃくちゃ遅い……しかし、特におかしな挙動はない。 ということは、 bug はない、ということか? westgrid での計算環境を整えよう! 調べたら、何と前回は3/12/2008であり…

nanoプロジェクト

alex 帰国。今後の予定をちょっと議論。 木曜、お昼に3者会議をしましょう、と。 10/16/2008: 三者会談、開催。 それまでに、私の方からの持ち出し可能なネタを考えておかないといけない。

EOF

slip の勉強。 今日はざらっと Kim-Karrila に目を通しなおす。 やっぱりきちんと製本されている本はいいな。(10/12/2008 の「私は LOVE を探しています」を参照。)

風通しの悪い組織は、本当に ugly なことが起きるようだ……。

と思ったのは、江田島の海自で起きた件(気分が悪いので、記事をコピーとかはしてない)。 これじゃ、暴走族とかヤクザ(あるいはカルト)と変わらんなあ。 思えば、時津風部屋で起きた話も、高校の野球部員がどうのこうのというのも、 全部、同じだよなあ。…

"Nobel Prize to Arch-Critic Krugman Is Blow to Bush"@bloomberg

"The Sveriges Riksbank Prize in Economic Sciences in Memory of Alfred Nobel 2008"@nobelprize.org すっかり見逃していたが、ノーベル経済学賞はクルーグマンだったのか。 付記:どうも、発表は経済が一番最後だったみたいで、 別に見逃していたわけでは…

「<経団連>移民受け入れ提言…人口減対策 定住前提に」@yahoo

今更……と思う一方で、まあ動かないよりはましかと思ったり。 しかし、効果が出るのは少し先の話だろうし、 雰囲気として色々と抵抗が出るんじゃないかな。 それこそマスコミがイメージを打ってくれれば、コロッといくんだろうが。

カナダの thanksgiving で、今日は休日。

夜、とうとうやっちまった。

見たら 6.4 の RC1 が出てたので ("FreeBSD 6.4-RC1 available..."@freebsd-stable)、我慢できなくなってしまったのだ。 本当は 7.1 を入れたいのだが、それはどうも更に一週間待ちらしいので……。 (多分、一週間後かそこらで、また、インストール大会をする…

"I'm Looking for Love!" (あるいは、「記憶違いか、老化のはじまりか?」というタイトルのエントリー。)

ここ数日、引越しあとの段ボールから出して本棚に積んである本の中から Love の弾性論の本を探しているのだが、ない。 過去のアマゾンのメールで Love とか "Treatise on the Mathematical Theory of Elasticity" とかで grep しても出てこない。 前から欲し…

「<訃報>俳優の峰岸徹さん 肺がんのため死去」@yahoo

何から辿ったのか忘れたけど(もしかしたらガンを公表した時のニュースだったかな)、 しばらく前に彼のブログを見て、トライアスロンを(けっこうまじめに)やっている姿を見て、 「ほお」と思っていたのだけど……。 サマリ:訃報

ryuon

RYUON - Documentsを久しぶりに update した。 と言っても User's Manual の stokes3 に与えるパラメータの部分だけ。 理論や algorithm などの詳細は section を切っただけ(Library for Stokesian Dynamics)。 手元のノートから cut-and-paste すればいい…

「英誌「大学ランキング」北京大学50位、東大は19位」@yahoo

"THE - QS World University Rankings 2008" ( ) だな。 いままで居たところを見ると、 20082007School NameCountry 5 7= CALIFORNIA Institute of Technology (Calt... United States 13= 15 JOHNS HOPKINS University United States 25 25 KYOTO Universit…

「ノーベル賞余波 二重国籍禁止を撤廃 自民法務部会 国籍法改正検討」@yahoo

引用: PT(自民党法務部会の国籍問題プロジェクトチーム)では 「正直者と有名人がバカを見る制度だ」(河野氏)、 「二重国籍を積極的に認めた方が日本人が世界に雄飛しやすい」(猪口邦子衆院議員) など改正論が根強い。 「正直者がバカを見る制度」は…

EOF

slip の勉強。 先日の続き。 積分方程式を、改めてきちんと押さえておく。

ryuon

confinement の debug -- dumbbell: 50-50-10-10 の計算 on BUE9: 昨日の続き。 途中で止まっていた。 dt を 1/10 にするがダメ。 siPC で走らせてみる。

「Douglas Prasher博士のケース、ノーベル化学賞の裏側で、日本の科学」@mitsuhiro

"Glowing Gene's Discoverer Left Out Of Nobel Prize"@npr バスの運転手じゃなくて、車屋の送迎バンの運転手だって。 ちなみに douglas prasher で検索してみたら "GFP history"というページがあって、 osamu shimomura に次いで言及されていた (douglas p…